وضعت وزارة النقل أسساً وضوابط جديدة تطبّق على السفن والبواخر التي ترغب بتسجيل نفسها تحت مظلة العلم السوري وهي مغايرة تماماً للتي كانت سابقاً، وأبرز شروطها: أن يكون تصنيفها لدى إحدى هيئات التصنيف الدولية ساري المفعول لمدة لا تقل عن ستة أشهر من تاريخ التسجيل، إضافة إلى أنه لا يمكن تغيير هيئة التصنيف السفينة بعد التسجيل إلا بعد موافقة المديرية العامة للموانئ شريطة أن تكون ضمن اللائحة المعتمدة من الوزارة، وأنه يمكن للمديرية العامة للموانئ منح أية هيئة تصنيف واردة في اللائحة المعتمدة من الوزارة، ويعتبر ذلك تفويضاً جزئياً لأية هيئة تصنيف واردة في اللائحة المعتمدة لدى الوزارة وذلك لمتابعة إجراءات أية كشوفات أو معاينات أو مراجعة خطط للسفن السورية بالنيابة عنها، ومن ضمن الشروط أيضاً: أن تقوم المديرية باعتماد أية هيئة حكومية وغير حكومية توقع اتفاقاً ثنائياً معها وفقاً لقرار لجنة السلامة البحرية، وأنه في حال ورود سفينة أو باخرة مسجّلة لدى هيئة غير معتمدة باللائحة المرفقة بالقرار فيمكن استثناؤها من اللائحة بناءً على وضعها الفني وبما يخدم المصلحة العامة.
يذكر أنه في عام 2000 تمّ تسجيل أكثر من 350 سفينة حاملة للعلم السوري، في حين ما بقي منها في العام الحالي لا يتجاوز عشر سفن، ويعدّ عام 2009 العام المفصلي في هذا السياق، حيث خرجت خلاله أكثر من 39 سفينة من تحت لواء العلم السوري.